Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C11orf49Q9H6J7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms