Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HIPK3Q9H422 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms