Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDGFDQ9GZP0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDGFDQ9GZP0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms