Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM31Q9BZY9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms