Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNKL1Q9BZJ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms