Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCO2Q9BYV7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms