Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms