Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS2Q9BXC9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS2Q9BXC9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms