Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4K2AQ9BTU6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4K2AQ9BTU6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms