Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTA3Q9BTC8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTA3Q9BTC8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms