Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NDFIP1Q9BT67 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NDFIP1Q9BT67 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms