Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NIPSNAP3BQ9BS92 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms