Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEC22CQ9BRL7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms