Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LPIN3Q9BQK8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms