Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED1Q99966 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms