Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN18Q99952 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN18Q99952 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms