Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAT1Q99536 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAT1Q99536 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms