Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN18Q96SJ8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms