Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UIMC1Q96RL1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms