Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARXQ96QS3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms