Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMAQ96QA5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMAQ96QA5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMAQ96QA5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms