Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC115Q96NT0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms