Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf49Q96NF6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms