Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF396Q96N95 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms