Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COG8Q96MW5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms