Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC43Q96MW1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms