Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMTD1Q96MG8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms