Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD8Q96LT4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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