Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRIQ1Q96JM4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRIQ1Q96JM4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRIQ1Q96JM4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
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