Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAMP1Q96JM3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAMP1Q96JM3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms