Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF479Q96JC4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF479Q96JC4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms