Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ABCC12Q96J65 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCC12Q96J65 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms