Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP2Q96HF1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms