Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LTV1Q96GA3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms