Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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FAM3DQ96BQ1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3DQ96BQ1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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FAM3DQ96BQ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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FAM3DQ96BQ1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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FAM3DQ96BQ1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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FAM3DQ96BQ1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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FAM3DQ96BQ1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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FAM3DQ96BQ1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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FAM3DQ96BQ1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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FAM3DQ96BQ1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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FAM3DQ96BQ1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3DQ96BQ1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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