Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms