Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC47Q96A33 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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