Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRG4Q92954 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRG4Q92954 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms