Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRN2Q92932 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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PTPRN2Q92932 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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PTPRN2Q92932 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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PTPRN2Q92932 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PTPRN2Q92932 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PTPRN2Q92932 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2Q92932 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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