Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRIPQ8WXE1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms