Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms