Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APPL2Q8NEU8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APPL2Q8NEU8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms