Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLRC2Q8NBF2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms