Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC89Q8N998 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC89Q8N998 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms