Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A9Q8IVB4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms