Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBP1Q86WP2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBP1Q86WP2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBP1Q86WP2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBP1Q86WP2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBP1Q86WP2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBP1Q86WP2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBP1Q86WP2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBP1Q86WP2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPBP1Q86WP2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GPBP1Q86WP2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GPBP1Q86WP2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPBP1Q86WP2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms