Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF550Q7Z398 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF550Q7Z398 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms