Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTF1AQ7RTS3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTF1AQ7RTS3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms