Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP27Q6ZUM4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP27Q6ZUM4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms