Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPGS1Q6ZTW0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms